Цитрин получил свое название из-за лимонно-желтого цвета. Окрашивающим веществом является железо. Природные цитрины встречаются редко. Большинство цитринов, имеющихся в продаже, обрели свой цвет в результате обжига аметиста  или дымчатого кварца. Бразильский аметист становится светло-желтым при температуре 470 °С, а некоторые виды дымчатого кварца уже при температуре 200 °С приобретают окраску цитрина.
Почти все обожженные цитрины имеют красноватый отлив. Природные цитрины, напротив, преимущественно окрашены в бледно-желтый цвет. В торговле цитрин часто называют баия-топазом, мадейра-топазом, пальмира- (пальмейра) топазом или рио-гранде-топазом. Такие названия создают иллюзию более высокой ценности камней и вводят в заблуждение. Если речь идет о цвете, лучше говорить о пальмира-цитрине или мадейра-цитрине; это корректное обозначение.
Месторождения природных цитринов: Бразилия, Мадагаскар, США (Колорадо), Аргентина, Мьянма, Намибия, Россия, Шотландия, Испания. Красиво окрашенные и прозрачные цитрины используют для колец с камнями и кулонов, менее качественные сорта перерабатывают для ожерелий.